获取途径存在明确的限制，太玄功并非通过常规师门传授或直接购买获得，其秘籍或碎片主要依赖于特定章节副本和多人协作任务的概率性掉落。玩家的探索和挑战区域被限定在如第二章的崇武楼、恶人村的老乞丐，第四章的胡家寨，以及第六章逍遥林的强盗头目等几个关键场景，这意味着获取过程具有随机性和地点特定性，需要投入时间重复挑战。
学习太玄功存在必须满足的前置条件，这构成了另一层使用限制。玩家需要完成全部八条经脉的冲穴，这一过程消耗大量的潜能与真气资源，并且至少需要完成一次角色传承后方有资格通过闭关修炼来掌握此武学，它无法像基础武功一样直接拜师学习，这种设定将太玄功的习得与角色中后期的成长阶段紧密绑定。
太玄功存在兼容性限制，它作为一项系数均衡的一拖三内功，其单项属性并非顶级，因此与某些追求极致爆发或拥有特殊机制的门派专属内功可能存在冲突。部分门派内功需要特定的属性值才能完全发挥威力，若强行与太玄功组合可能导致实战效果打折扣，这就要求玩家在选择时必须考虑武学体系的整体协调性而非简单叠加。
将太玄功应用于速转玩法时，其限制主要体现在资源规划与玩法选择性上。尽管其高转化率与可传承特性是速转的核心优势，但玩家需要在上一转就将太玄功修炼至较高等级以实现有效继承，这会消耗大量潜能丹并可能占用其他武功的修炼时间。专注于速转通常会使得日常任务体验变得相对固定，在一定程度上限制了同一转生周期内对其他门派特色武学的深度体验。
太玄功本身也存在性能限制。它通常被认为是在中期过渡或支撑速转策略的优质选择，而非绝大多数流派的终极毕业武学。角色进程推进，玩家为了追求更高的战力上限，往往需要根据门派路线转向其他更为顶尖的内功或外功组合，太玄功在此刻的定位更接近于一块重要的跳板。
